Немец. Род деятельности к моменту ареста - "Подмосковный химлесхоз: мастер". Был беспартийным.

Последний раз Яков Францевич Янцен был арестован 12 февраля 1937 г.

Проходил по следственному делу № П-70483. Приговор вынесен Комиссией НКВД и Прокуратуры СССР 27 марта 1938 г. Был обвинен по статье 58-10-11 УК. Суть обвинения: принадлежность к контрреволюционной националистической группировке немцев-сектантов (менонитов), вел пораженческую агитацию, призывал отказываться от службы в Красной Армии. Был расстрелян 27 апреля 1938 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 13 июня 1964 г. за отсутствием состава преступления.