Родился в 1896 г. Место рождения: Коми АССР,в с. Визинга.
Русский.
Получил среднее образование.
Род деятельности к моменту ареста - "2-й стрелковый отряд охраны НКПС ст. Узловая: бухгалтер". Был беспартийным.Последний раз Сергей Васильевич Шипунов был арестован 9 августа 1937 г.
Приговор вынесен Тройкой при УНКВД СССР по Московской обл. 28 августа 1937 г. Был расстрелян 30 августа 1937 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 6 января 1958 г. за отсутствием состава преступления.