Родился в 1902 г. Место рождения: с. Орловка Холмского р-на Черниговской обл.
Украинец.
Получил среднее образование.
Род деятельности к моменту ареста - "1921-1935 секретарь, председатель общины, пресвитер евангелистов с.Орловка Холменского р-на, Черниговской обл.; с 1936 письмоносец с. Очаково". Был беспартийным.Последний раз Прокофий Иванович Полегенько был арестован 4 сентября 1937 г.
Проходил по следственному делу № 6802. Приговор вынесен тройкой при УНКВД СССР по Московской обл. 22 сентября 1937 г. Суть обвинения: Высказывания против Советской власти. Был расстрелян 23 сентября 1937 г. на Бутовском полигоне НКВД под Москвой. Реабилитирован 19 июля 1989 г. за отсутствием состава преступления.